Auf der Sekundarstufe I in Lengnau wird nach dem Schulmodell Manuel unterrichtet. Das heisst, dass nach der 6. Klasse keine absolute Trennung zwischen Real- und Sekundarklassen erfolgt. In den Fächern Deutsch, Französisch und Mathematik wird in 2 Niveaus unterrichtet ( Sek. und Real ). Ausschlaggebend für die Zugehörigkeit zur Sek- oder Realklasse sind diese 3 Hauptfächer: Wer in 2 oder 3 Fächern in einem Niveau eingeteilt ist, besucht in allen Fächern diese Stufe.
Ein Schwerpunkt in den 8. und 9. Klassen ist die Berufswahl. In den 8. und 9. Klassen finden die Übertritte in weiterführende Schulen statt.
